Сложно на расстоянии говорить конкретно о Вас, но общая картина примерно такова:
- у большинства людей, которые занимаются йогой давно и регулярно, таких явлений нет;
- в начале своей йогической практики многие из этих людей сталкивались с подобными явлениями.
Эта простая посылка некоторых вдохновляет, некоторых пугает

Если Вы чётко связываете возникновение этих явлений с началом практики хатха-йоги - это, в общем-то, неплохо. Значит, благодаря практике Вы уже прикоснулись к каким-то загрязнениям, которые начали выходить на поверхность. Это проявляется в виде в том числе и вот такого утреннего дискомфорта. Организм очищается. Единственное, что нужно - быть очень внимательным и практиковать, не перешагивая границу между конструктивным и разрушительным.
Попробуйте сделать бОльший акцент на статических проработках. Возможно, пока что не следует практиковать интенсивную динамику. Поменьше прогибов, умеренные скручивания и - важно - отстройка правильной техники выполнения наклонов - непременно ВЫТЯГИВАЯСЬ вперёд. Не округлять спину в наклонах, а вытягивать её из таза вдоль позвоночника. И - статика. Приняли асану - и на пару-тройку минут расслабление, вытягивание, внимательное наблюдение ощущений тела.
Хорошее, имхо, для Вас упражнение - поза собаки мордой вниз. Пятки стоят на полу, ноги выпрямлены, копчик тянется назад-вверх, корпус, руки, голова - в одной плоскости.
